Amino Acid Synthesizer
Questa applicazione utilizza un metodo auto-consistente per tradurre sequenze di aminoacidi in suono udibile. Il metodo di sonificazione utilizza le vibrazioni in modalità normale dei blocchi di proteine degli amminoacidi per calcolare una rappresentazione udibile di ciascuno dei 20 amminoacidi naturali, che è completamente definito dalla sovrapposizione delle rispettive vibrazioni naturali. Le frequenze vibrazionali sono trasposte nello spettro udibile seguendo il concetto musicale di equivalenza transposizionale, suonando o scrivendo musica in un modo che lo fa suonare più alto o più basso mentre si mantengono le relazioni tra i toni o gli accordi suonati. Questo metodo di trasposizione garantisce che i valori relativi delle frequenze vibrazionali all'interno di ciascun amminoacido e tra i diversi aminoacidi siano mantenuti.
Lo spettro di frequenze e il suono caratteristici associati a ciascuno degli amminoacidi rappresentano un tipo di scala musicale che consiste di 20 toni unici, la "scala degli amminoacidi". Per creare uno strumento riproducibile, ciascun tono associato agli amminoacidi viene assegnato a un tasto specifico sullo schermo del telefono, che può essere riprodotto. L'app consente agli utenti di registrare sequenze riprodotte, modificarle e condividerle per ulteriori elaborazioni (ad esempio creando proteine sintetiche basate sulla musica composta o prevedendo la struttura piegata di una sequenza creata attraverso la musica).
L'approccio alla creazione di rappresentazioni audio di sequenze di proteine offre una nuova strada per la comprensione di schemi, variazioni e mutazioni di sequenza e offre un meccanismo di sensibilizzazione per spiegare il significato delle sequenze di proteine. Il metodo riportato qui offre anche informazioni sull'effetto delle mutazioni attraverso il suono.
Pubblicazione scientifica:
[1] Yu, C. H., Qin, Z., Martin-Martinez, F. e Buehler, M. J. Un metodo di sonificazione auto-consistente per tradurre sequenze di amminoacidi in composizioni musicali e applicazione nella progettazione di proteine usando AI, in sottomissione.
App sviluppata da Eric L. Buehle
Lo spettro di frequenze e il suono caratteristici associati a ciascuno degli amminoacidi rappresentano un tipo di scala musicale che consiste di 20 toni unici, la "scala degli amminoacidi". Per creare uno strumento riproducibile, ciascun tono associato agli amminoacidi viene assegnato a un tasto specifico sullo schermo del telefono, che può essere riprodotto. L'app consente agli utenti di registrare sequenze riprodotte, modificarle e condividerle per ulteriori elaborazioni (ad esempio creando proteine sintetiche basate sulla musica composta o prevedendo la struttura piegata di una sequenza creata attraverso la musica).
L'approccio alla creazione di rappresentazioni audio di sequenze di proteine offre una nuova strada per la comprensione di schemi, variazioni e mutazioni di sequenza e offre un meccanismo di sensibilizzazione per spiegare il significato delle sequenze di proteine. Il metodo riportato qui offre anche informazioni sull'effetto delle mutazioni attraverso il suono.
Pubblicazione scientifica:
[1] Yu, C. H., Qin, Z., Martin-Martinez, F. e Buehler, M. J. Un metodo di sonificazione auto-consistente per tradurre sequenze di amminoacidi in composizioni musicali e applicazione nella progettazione di proteine usando AI, in sottomissione.
App sviluppata da Eric L. Buehle
Categoria : Istruzione
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